אחת הבעיות הנפוצות בהתייחס ללהקות בחצר האחורית נוגעת לתוכניות האכלה לקויות או לקויות שעלולות להוביל למחסור בוויטמינים ומינרלים עבור הציפורים. ויטמינים ומינרלים הם מרכיבים חשובים מאוד בתזונה של תרנגולות, אלא אם כן מנה מנוסחת היא מזון, סביר להניח שייווצרו מחסור.

עופות דורשים את כל הוויטמינים המוכרים מלבד C. ויטמינים מסוימים מסיסים בשומנים, בעוד שאחרים מסיסים במים. חלק מהתסמינים של מחסור בוויטמין הם כדלקמן:
ויטמינים מסיסים בשומן
ויטמין A ירידה בייצור הביצים, חולשה וחוסר גדילה
ויטמין D ביצים דקיקות קליפות, ייצור ביצים מופחת, עיכוב בצמיחה, רככת
ויטמין E קרסים מוגדלים, אנצפלומלאציה (מחלת אפרוח מטורפת)
ויטמין K קרישת דם ממושכת, דימום תוך שרירי
 
ויטמינים מסיסים במים
תיאמין (B1) אובדן תיאבון ומוות
Riboflavin (B2) שיתוק אצבע מתולתל, צמיחה לקויה וייצור ביצים לקוי
דלקת עור של חומצה פנטותנית ונגעים בפה וברגליים
ניאצין כפופות רגליים, דלקת בלשון ובחלל הפה
כולין צמיחה לקויה, כבד שומני, ירידה בייצור הביצים
ויטמין B12 אנמיה, צמיחה לקויה, תמותה עוברית
חומצה פולית צמיחה ירודה, אנמיה, ייצור נוצות וייצור ביצים לקויים
ביוטין דרמטיטיס בכפות הרגליים וסביב העיניים והמקור
מינרלים חשובים גם לבריאות ולרווחה של עופות. להלן כמה מהמינרלים והתסמינים החשובים של מחסור במינרלים:
מינרלים
סידן איכות קליפת ביצה ירודה ויכולת בקיעה ירודה, רככת
רככת זרחן, איכות קליפת ביצה ירודה ויכולת בקיעה
מגנזיום מוות פתאומי
מנגן פרוזיס, יכולת בקיעה לקויה
אנמיה של ברזל
אנמיה נחושת
יוד זפק
אבץ נוצות גרועות, עצמות קצרות
קובלט צמיחה איטית, תמותה, יכולת בקיעה מופחתת
כפי שצוין לעיל, מחסור בויטמינים ומינרלים עלול לגרום לבעיות בריאות רבות עבור תרנגולות, כולל במקרים מסוימים, מוות. לפיכך, כדי למנוע חוסרים תזונתיים, או כאשר מציינים תסמיני מחסור, יש להקפיד על האכלת עופות מאוזנת בוויטמינים והמינרלים הנדרשים.